Система мікрозрошення – це технологічні вартісні системи, які потребують дуже якісної водоподготовки. Застосування системи фільтрації дозволяє запобігти засміченню та виходу з ладу системи мікрозрошення.
Фільтри поділяють на фільтри грубої очистки та тонкої очистки. При водозаборі з відкритих природних водойм та каналів бажано використовувати обидві системи.
При використанні свердловин та водонакопичувачів або штучних водойм можна обмежитись використанням фільтрів тонкої очистки.
До фільтрів грубої очистки відносяться гідроциклонні та піщано-гравійні фільтри. До фільтрів тонкої очистки відносяться дискові та сітчасті фільтри.
Для кожного виду спринклерів або крапельниць регламентується використання визначеного рівня фільтрації.